La rete scolastica presente nel Comune di San Giovanni al Natisone, può definirsi completa, dall'asilo nido alle superiori.
Vanto del Comune ed in particolare di tutto l'ambito distrettuale dell'industria della sedia è l'Istituto Professionale di Stato di via Antica. Dedicato al settore legno-arredo è specializzato nella formazione dei futuri operatori e professionisti che questo settore richiede. Modernamente attrezzato con laboratori e macchinari ad alta innovazione tecnologica è in grado di garantire ai giovani un immediato impiego ed un avvenire di sicuro successo. Due i percorsi formativi: qualifica professionale (tre anni di corso) e maturità professionale (due anni post-qualifica). Qualifica professionale Il percorso scolastico prevede, come tappa intermedia, la qualifica professionale con tre anni di corso che costituisce già un titolo di specializzazione per accedere al mondo del lavoro.
Maturità professionale Gli studi del biennio post-qualifica, nei vari ambiti prescelti, completano la preparazione dello studente sia in ambito teorico che pratico-applicativo. I giovani in possesso del diploma di maturità professionale sono molto richiesti dalle realtà produttive del territorio, tanto che la maggior parte dei diplomati ricevono offerte di lavoro ancora prima della conclusione degli studi.